The Callisto Protocol се оказа доста противоречиво приета от геймърите игра. Собствениците на конзоли хвалят графиката, но са със смесени чувства към безкрайните анимации и геймплея. Собствениците на компютри обаче са изцяло с негативно мнение към заглавието.

В Steam оценката на The Callisto Protocol е изключително ниска. Причината е слабата оптимизация на играта за РС. Засичанията са чести и се случват дори на компютри за няколко хиляди евро.

Проблемите с производителността правят играта почти невъзможна за игра. "Дори кът сцените засичат", оплакват се геймърите. Към този момент едва 29% от ревютата в Steam са положителни.